El estilo de la caja es barroco pero no presenta la decoración exuberante típica de las cajas barrocas del órgano castellano, sino que muestra unos listones dorados con tonos marrones y verdes jaspeados. La fachada del órgano posee un torreón de nueve tubos cantantes en forma de mitra y dos castillos laterales en mitra, con once tubos cantantes cada uno. La tubería es la original excepto la címbala de ambas manos y algunos caños sueltos de la trompeta magna interior. La mecánica del interior está toda ella restaurada, y además el teclado y los tiradores de los registros son de nueva factura. Según consta en la inscripción del secreto, construyeron y asentaron el órgano de esta iglesia los hermanos Antonio y Tomás Ruiz Martínez, vecinos de Sasamón, en 1788, aunque en la escritura para esta obra sólo figura Antonio, quien se encontraba construyendo el órgano de la Iglesia de San Pedro de Amusco cuando contrata la hechura del de San Pedro de Frómista. Ese mismo año también llevó a cabo los arreglos del órgano de Frechilla, habiendo ya realizado anteriormente los trabajos de Támara o Aranda de Duero.

David Largo